没太看明白 ...
你的scp命令是在远程服务器上执行的?
那那些文件就被拷贝到你的远程服务器而不是本机了。
你可以下载一个scp的windows版本,pscp (在putty的官方网站有下),然后在本机执行
pscp -r user@hostname:/xxxx/xxx/xxx
或者更简单,直接用带图形界面的winscp